1905年，江西农工商矿务总局和学务处在农事试验场内筹设江西实业学堂，招生100余人，初办普通科，旋即改为高等预科，傅春官为总办，龙钟淞为监督。
1907年，江西实业学堂改隶江西提学使司，改称江西高等农业学堂，江西农业教育始于此。
1912年，江西高等农业学堂和高等森林学堂合并，改名为江西高等农业学校，随后又改称高等农林专门学校。
1927年，江西创设中山大学，江西公立农业专门学校并入该校，为其农业专门部，不久大学停办，改为江西省立农业专科学校。
1940年10月31日，国立中正大学在泰和杏岭举行开学典礼，学校设文法学院、农学院、工学院，农学院设立农艺系、森林系、畜牧兽医系，周拾禄任农学院院长。
1949年，农专一部分并入国立中正大学农学院，别的部分组建为江西南昌农业专科学校。
1949年9月，原中正大学由新建县望城岗迁南昌市彭家桥，改名南昌大学，下设农学院，院长杨惟义，不久江西省农业专科学校一部分并入农学院，内设农艺、森林、畜牧兽医3系。
1952年，中国高等院系调整，南昌大学农学院农艺、兽医两专业和广西、湖南、河南三所农学院的兽医专业，以及江西南昌农业专科学校农艺科、江西省兽医专科学校合并，成立江西农学院，中科院学部委员，教授杨惟义任院长，校址设在南昌莲塘伍农岗，农学院内设农学、兽医两系和农艺、兽医中技部（中等）。
1958年，江西劳动大学创办，总校设在南昌市郊，以办大专为主，分校设在江西省各地，以办中专和初技为主。
1968年10月，江西农学院撤销，随后并入江西劳动大学总校，绝大多数教职员工分批下放宜春地区各县农村劳动，农学院实习农场由南昌县接管，后合并为莲塘垦殖场。
1978年4月，经国务院批准，江西劳动大学列为全国重点大学，同年江西劳动大学总校恢复招收研究生。
1980年5月．江西省委、省人民政府决定：共大总校与分校脱钩，总校称“江西劳动大学”，实行全日制办学，为江西省综合性的高等农业院校。
1980年11月20日，江西省委、省人民政府批准，江西劳动大学改名为江西农业大学。
1981年，经国务院学位委员会批准，学校为首批有硕士学位和学士学位授予权单位。
2015年12月，国家林业局与江西省人民政府签署协议，共建江西农业大学。
截至2020年6月，学校拥有7个国家级一流专业建设点，5个国家特色专业，11个省级一流专业建设点，教育部专业综合改革试点项目1个，教育部卓越农林人才教育培养计划项目2个，9个省级特色专业，省级人才教育培训创新实验区4个，省级卓越工程师培养计划项目3个，省级卓越农林人才教育培训计划项目4个，省级专业综合改革试点项目6个；拥有教育部农科教人才教育培训基地1个，教育部“卓越农林人才教育培养计划”项目2个，国家级实验教学示范中心2个，省级精品课程17门，省级精品资源共享课17门。
国家级特色专业（5个）：动物科学（获批年份：2007年）、农学（获批年份：2007年）、林学（获批年份：2008年）、农林经管（获批年份：2009年）、生物工程（获批年份：2010年）
教育部卓越农林人才教育培养计划（2个）：动物科学（获批年份：2014年）、林学（获批年份：2014年）
国家级实验教学示范中心（2个）：植物生产实验教学示范中心（获批年份：2008年）、动物生产与疾病防控实验教学中心（获批年份：2013年）
教育部农科教人才教育培训基地（1个）：江西农业大学高安肉牛牦牛农科教合作人才教育培训基地（获批年份：2012年）
省级特色专业（9个）：食品科学与工程（获批年份：2008年）、园林（获批年份：2008年）、软件工程（获批年份：2008年）、动物医学（获批年份：2008年）、园艺（获批年份：2010年）、农业机械化及其自动化（获批年份：2010年）、土地资源管理（获批年份：2010年）、生物技术（获批年份：2010年）、英语（获批年份：2010年）
省级卓越工程师教育培养计划（3个）：食品科学与工程（获批年份：2012年）、农业机械化及其自动化（获批年份：2013年）、农业水利工程（获批年份：2014年）
省级卓越农林人才教育培养计划（4个）：农学（获批年份：2013年）、动物科学（获批年份：2014年）、林学（获批年份：2014年）、园林（获批年份：2014年）
省级专业综合试点改革（6个）：农学（获批年份：2012年）、林学（获批年份：2012年）、动物科学（获批年份：2013年）、农林经管（获批年份：2013年）、土地资源管理（获批年份：2014年）、生物工程（获批年份：2014年）
省级实验教学示范中心（7个）：基础化学实验教学示范中心（获批年份：2005年）、计算机实验教学示范中心（获批年份：2006年）、经济与管理实验教学示范中心（获批年份：2007年）、植物生产实验教学示范中心（获批年份：2008年）、动物生产与疫病防控实验教学示范中心（获批年份：2008年）、农产品贮藏加工工程实验教学示范中心（获批年份：2009年）、农业资源与环境实验教学示范中心（获批年份：2009年）
省级人才教育培训创新实验区（4个）：面向产业需求的工程型软件人才教育培训模式创新实验区（获批年份：2009年）、动物遗传育种应用型人才教育培训模式创新实验区（获批年份：2009年）、植物生产类复合型人才教育培训模式创新实验区（获批年份：2011年）、开放体验式培养林业基层应用型人才创新实验区（获批年份：2011年）
省级精品课程（17门）：森林培育学（获批年份：2003年）、动物繁殖学（获批年份：2003年）、经济学原理（获批年份：2003年）、微生物学（获批年份：2003年）、C语言程序设计（获批年份：2003年）、农业气象学（获批年份：2003年）、环境监视测定（获批年份：2003年）、经济林栽培（获批年份：2009年）、数字逻辑（获批年份：2009年）、政治经济学原理（获批年份：2009年）、土地利用规划（获批年份：2009年）、生物分离工程（获批年份：2009年）、农业植物病理学（获批年份：2009年）、动物传染病学（获批年份：2011年）、畜产品加工学（获批年份：2011年）、电工电子技术（获批年份：2011年）、思想道德修养与法律基础（获批年份：2011年）
截至2017年9月，该校研究生获国家留学基金委资助项目27项；获“全国优秀博士学位论文提名论文”1篇，江西省优秀博士学位论文10篇，江西省优秀硕士学位论文40篇，江西省研究生创新专项资金项目177项；在全国专业学位优秀硕士学位论文评选中，获得2篇全国农业推广硕士专业学位优秀论文，2篇全国兽医硕士专业学位优秀论文，1篇全国林业硕士专业学位优秀论文；有2位研究生荣获“2013年中国大学生自强之星”提名奖和“2013年江西省大学生年度人物”入围奖，1位研究生获“大北农杯”第一届全国农林院校研究生学术科技作品竞赛特等奖，1位毕业研究生荣获首届“中国杰出兽医”称号。
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