JD-CQX5生态环境监测站是采用生态学的很多方法和手段，从不同尺度上对各类ECO结构和功能的时空格局的度量，主要是通过监测ECO条件、条件变化、对环境压力的反应及其趋势而获得。国内有学者提出“生态监测就是运用可比的方法，在时间和空间上对特定区域范围内ECO或生态系统组合体的类型、结构和功能及其组合要素等进行系统地测定和观察的过程，监测的结果则用于评价和预测人类活动对生态系统的影响，为合理规划利用资源、改善生态环境和自然保护提供决策依据，这一定义似乎从方法原理、目的、手段、意义等方面作了较全面的阐述。

  JD-CQX5在监测对象上，生态环境监视测定站既不同于城市环境质量监测，也不同于工业污染源监测。从环境监测发展历史来看，目前所指的生态监测主要侧重于宏观的、大区域的生态破坏问题，它具有反映人类活动对我们所处的生态环境的全貌、有机综合影响的优点。如近年来积极开展的福建省湿地生态环境监视测定，河南省渔业生态环境监视测定，南极中山站近岸海域生态环境监视测定，以及在我国开展生态环境监视测定较早，近几年又做了大量工作的新疆荒漠生态环境监视测定。

  JD-CQX5生态环境监视测定站的对象可分为农田、森林、草原、荒漠、湿地、湖泊、海洋、气象、气候、动植物等。应当看到，生态监测是环境监测的拓宽，除了新的理论、技术和方法外，环境监测的理论和实践必是生态监测得以发展和完善的基本保证。景观生态学、农业生态学、森林生态学、淡水生态学、海洋生态学、荒漠生态学、脆弱带生态学、地球化学、气象学、物候学、水文学、环境经济学、人文物理学等的理论和实践对生态监测更是大有裨益。